Zalijevanje je jedan od glavnih zadataka upravljanja biljkama Bonsai. Zalijevanje se čini jednostavno, ali nije ga lako zalijevati. Zalijevanje treba provesti prema biljnoj vrsti, sezonskim promjenama, razdoblju rasta, razdoblju cvjetanja, razdoblju spavanja i vremenskim uvjetima biljke. Savladavanje vremena i količine zalijevanja vrlo je važno za rast biljaka. Smrt nekih biljaka Bonsai izravno je povezana s nepravilnim zalijevanjem.

Osim što opskrbljuje vodu i hranjive tvari biljkama u saksiji, tlo lonca također održava normalno disanje zraka. Kad tlo lonca ima dovoljno vlage, čestice tla šire se, ističući zrak u prazninama između čestica, uzrokujući nedostatak zraka u loncu; Kad je tlo lonca suho ili relativno suho, čestice tla se smanjuju, volumen postaje manji, a praznine između čestica ponovno se pojavljuju. Praznine su ispunjene zrakom.

Kako se tlo mijenja između suhog i vlažnog, zrak u loncu također kontinuirano cirkulira, omogućujući biljnim korijenima da normalno diše. Nakon svakog zalijevanja, korijenje biljke moći će tolerirati nedostatak kisika u tlu lonca u kratkom vremenu. Međutim, ako je lonac duže vrijeme previše vlažno, što rezultira dugoročnim nedostatkom kisika, to će uzrokovati eroziju korijena i druge bolesti; Ako je tlo dugo suho, iako u loncu ima dovoljno kisika, biljke ne mogu dugo apsorbirati vodu, što također šteti za rast biljaka i može čak i prouzrokovati umrijeti. Stoga, prilikom zalijevanja biljaka bonsaija, princip "ne zalijevajte ih kad su osuše, temeljito ih zalijevajte".

Nedovoljno zalijevanje i dehidracija biljaka uzrokovat će da se grančice motaju i natapaju, a lišće se osuši, požute i otpada. U slučaju crnogoričnih vrsta, igle će postati mekane i izgubiti svoj snažan i bodljikav osjećaj. Kad je nedostatak vode jak, korteks grana se smanjuje poput guske. Ako se susrećete s ovom situacijom ljeti, biljku biste trebali odmah premjestiti na zasjenjeno mjesto. Nakon padova temperature, prvo prskajte vodu po lišću, a zatim sipajte malo vode u lonac, a zatim temeljito sipajte vodu nakon jednog sata.

Za teško dehidrirane biljke, budite sigurni da ne zalijevajte dovoljno odjednom, jer kad se biljka ozbiljno dehidrira, korijenski korteks se smanjio i blizu je ksilema. Ako se odjednom isporuči velika količina vode, korijenski će se sustav proširiti zbog brzog apsorpcije vode, što uzrokuje puknuće kore, što dovodi do postrojenja za biljke, tako da mora postojati postupni postupak prilagodbe. Nakon što biljke koje su ozbiljno prolazile vode podvrgnute gore navedenom tretmanu, najbolje je održavati ih ispod hlada nekoliko dana, a zatim ih uzgajati na suncu nakon što su jake. Međutim, nemojte preplaviti. Osim što biljke strmo rastu, utječući na oblik stabla i ukrasnu vrijednost, prekomjerno zalijevanje također može lako uzrokovati truljenje korijena i smrt. Minijaturni bonsai lonci zahtijevaju manje tla, pa ih je posebno važno zalijevati u pravo vrijeme i u pravoj količini.